Dentro del Centro de Estudios Conservacionistas de la Universidad de San Carlos de Guatemala se encuentra la unidad del Sistema Universitario de Áreas Protegidas. Esta tiene a su cargo siete áreas siendo: Biotopo para la conservación del manatí “Chocon Machacas” ubicado en el departamento de Izabal; Biotopo protegido para la conservación del quetzal “Mario Dary Rivera” en el departamento Cobán, Reserva natural de usos múltiples Monterrico en el departamento de Santa Rosa y en el área de Petén se encuentran Biotopo Cerro Cahuí, Biotopo El Zotz “San Miguel la Palotada”, Biotopo Laguna del Tigre-Río Escondido y Biotopo protegido Naachtun Dos Lagunas.